浙江舟山市拥有三所高等院校，分别是浙江海洋大学、浙江海洋大学东海科学技术学院以及浙江大学舟山校区。

浙江海洋大学是一所国家海洋局与浙江省人民政府共建的教学研究型大学。它起源于1958年创建的舟山水产学院，1975年更名为浙江水产学院，1982年成为全国首批获得学士学位授予权的高校之一。学校拥有理学、工学、农学、医学、经济学、法学、文学、管理学、艺术学等学科门类，其中海洋科学、水产养殖学等学科具有显著优势。

浙江海洋大学东海科学技术学院（ZHEJIANGOCEANUNIVERSITYDONGHAISCIENCEANDTECHNOLOGYCOLLEGE）位于浙江省舟山市。该学院成立于2000年，是经中华人民共和国教育部和浙江省人民政府批准，以浙江海洋大学为依托创建的一所按民办机制运作的全日制普通本科院校。学院以应用型人才培养为目标，致力于为地方经济和社会发展提供智力支持。同时，它也是浙江省首批“加强应用型建设试点本科院校”之一。

浙江大学舟山校区于2012年6月10日，浙江大学与舟山市人民政府共同签署了“浙江大学-舟山市人民政府共建浙江大学舟山校区（浙江大学海洋学院）合作协议”。校区选址在舟山市临城惠民桥新区，总建筑面积达24万平方米的校园于2012年开始动工，并于2015年正式完工。浙江大学舟山校区依托浙江大学的雄厚科研实力和教育资源，致力于海洋科学、海洋技术等领域的研究和人才培养。

这些学校为舟山市提供了优质的教育资源，不仅促进了当地经济的发展，也为学生提供了广阔的学术发展空间。