南昌大学抚州医学院的毕业证书是由南昌大学颁发的。招生计划则整合于南昌大学的总计划中。录取的学生属于南昌大学第二批本科医学专业学生，全部纳入南昌大学学籍管理体系。遵循南昌大学的教学计划与教育管理方式，在抚州医学院接受培养。学生完成学业后，可获得教育部统一编号的南昌大学毕业证书。对于满足学士学位申请条件的本科专业毕业生，还能获取南昌大学学士学位证书。