消防安全合格证的申请程序较为明确，由经营主体向当地的公安机关消防机构提出申请。在准备材料时，需确保齐全且准确。

申请时，需要提交的材料包括消防安全检查申报表，以及营业执照的复印件或工商行政管理机关出具的企业名称预先核准通知书。如果有涉及建设工程，还需提供依法取得的消防验收或备案的法律文件复印件。此外，消防安全制度、灭火和应急疏散预案也是必不可少的文件。

如果经营场所是多个单位共用的公众聚集场所，则还需提交一份消防安全管理协议的复印件，此协议需详细规定各共用单位之间的消防安全责任和义务。

对于员工，应确保他们已接受岗前消防安全教育培训，并记录相关培训内容。同时，自动消防系统操作人员需持有消防行业特有工种职业资格证书，提供相应的复印件。

除上述具体要求外，可能还有其他需要申报的材料，具体细节还需咨询当地的公安机关消防机构，以确保材料齐全，申请过程顺利。