根据财政部、国家税务总局的有关规定，企业在年度审计中查出的需要调整的事项，应当在计入审计时当年的帐簿，并调整审计年度及以前相关年度的财务报表。涉及税收问题的，应当在审计发现问题时，向税务机关补交税款或者申请退税（法律法规规定不得或不再退税的除外）。

对于你的问题，在审计结束前，审计人员会将需要调整的分录一并列示清单交给你们。你可以根据审计调整分录分析编制记帐凭证并入帐（审计调整分录与会计分录是有区别的，其基础是报表，即所说的调表不调帐）。相关税收问题的会计处理，审计调整分录应当全部涉及，你只需分析后照作即可。

不过，应当注意的是，由于调整涉及减少收入，从而导致减少已申报的应交增值税额。由于增值税的特殊性，在处理时需分别不同情况办理。如果属于提前确认收入，并且在审计调整之前已经实现销售收入的话，那么，一般只需调整相关报表（包括损益表）的期初期末数和本期上期发生数，不需要对帐簿进行调整。如果不是这样的话，那么：

1.减少收入所涉及的原始发票的发票联能够追回且认为需要追回的，按照追回的发票联，开具红字发票从而冲销多计的收入。该红字发票附于相关调整收入及销项税额的记帐凭证后作为附件。并在帐务调整时的当月，计入增值税申报表中。注意，如果调整分录计入审计年度而非按规定通过“以前年度损益调整”计入做出调整的当月的话，该月份的申报表与帐簿记录可能存在出入，你可在适当的位置注明原因，以备日后审查。

2.减少收入所涉及的原始发票的发票联无法追回或者认为不需要追回的，且该错帐属于提前确认收入的话，则可以不需进行发票的特别处理，并将该减少的销项税额由应交增值税转入未交增值税中，直到该收入实际确认时自动抵销。注意，在这段时间内，申报表上的应交税款比未交增值税科目的余额要大，大的数额即为审计调整的减少的销项税额。

3.减少收入所涉及的原始发票的发票联无法追回的，且该减少的销项税额不可能从以后期间得到转回的，那么，对这一笔减少的销项税额，只能计入管理费用中了，由企业自行承担了。不过这种情况一般不会发生，且即使发生，审计人员也会发现，并计入审计年度的会计报表中。

另外，“以前年度损益调整”科目在《企业会计制度》中没有被取消，科目号5801。调整损益的合计金额，转入“利润分配——未分配利润”科目，结转后，“以前年度损益调整”科目应无余额。

最后，对于税务人员，建议你的调整分录计入审计年度的最后一个月，或者按规定计入调整时的当月。这样，如果税务人员提出某月申报表与帐簿数据不一致的话，那么，你可以将从审计年度最后一个月起到该调整影响完全消除的月份为止，相关涉税数据合计数，在申报表与帐簿之间进行核对比较相符，从而向其说明有关月份存在差异的原因。

对于所得税方面，应当按照经审计的会计报表进行汇算清缴。如果汇算清缴日先于审计报告日的话，你可以向主管税务机关提出二次修正申报。