工程防护措施主要包括：物理防护、化学防护、生物防护和安全管理措施。

1. 物理防护：主要是通过物理手段来减少工程事故风险。如设置护栏、围栏等安全设施，防止人员进入危险区域；使用高强度材料加固建筑结构，提高建筑物的抗震、抗风等能力；在易发生滑坡、泥石流等地质灾害的区域，采用土石方工程进行治理，减少灾害发生的可能性。这些措施能够直接有效地减少或避免工程事故的发生。

2. 化学防护：主要是针对化学工业中的腐蚀性、有毒有害物质采取的防护措施。例如，对化工设备、管道进行防腐处理，防止化学腐蚀；对有毒有害物质进行封闭管理，防止泄漏；对生产过程中的有害气体进行净化处理，确保空气质量等。这些措施能够保护工程结构不受化学侵蚀，保障人员的生命安全。

3. 生物防护：主要是针对工程建设中的生物安全问题采取的防护措施。如疫苗接种、疫病监测、生态环境恢复等。在工程建设过程中，应采取有效措施保护生态环境，防止对动植物造成破坏；同时，对可能传播的疾病进行预防和控制，确保人员的健康。

4. 安全管理措施：不仅是工程防护措施的一部分，更是整个工程建设中的重要保障。包括制定完善的安全管理制度和操作规程，进行安全教育和培训，开展安全检查与隐患排查，制定应急预案等。这些措施能够提高人员的安全意识，预防事故的发生，减轻事故带来的损失。

综上所述，工程防护措施涵盖了物理、化学、生物等多个方面，以及全面的安全管理措施，旨在确保工程建设的顺利进行和人员的安全健康。