西南交通大学医学院交通不便，发展受到限制。西南交通大学迁到四川时是在峨眉山，山区的交通不方便。西南交通大学医学院是在2014年7月8日由西南交通大学与成都市第三人民医院及7月10日由西南交通大学与西部战区总医院三方共同签署战略合作协议共建的，三方共同签署战略合作协议，正式揭牌建立西南交通大学医学院。