生物工程很强，交大有强大的工科、医学、管理科学3大支柱，另外理科、社会科学全国前列。最好的专业有船舶与海洋工程（全国第一），机械工程（全国第一），临床医学（全国第一），口腔医学、基础医学、材料科学，微电子，核物理，航空航天，电子信息与电气工程，机械动力，工业设计。较好的专业有法学，传播学，日语，德语，经济学。有著名的商学院：安泰经济管理学院、上海高级金融学院、中欧国际工商学院（只能说是半个交大的，但其董事长是交大校长），