职员使用假发票报销费用属侵吞公司财产行为，所在单位也可能因此“背黑锅”。根据相关税收法律、法规营业额规定，部分行业计税金额为收入款项减其营业额减除项目，营业额减除项目支付款项凭证，必须是发票或合法有效凭证；将不合法、无效的发票入账冲减营业收入，会造成少申报缴纳营业税及附加和企业所得税。构成涉嫌偷税罪，地税部门就会追究个人和公司的责任，对使用者可处以2000元以上1万元以下的罚款。你公司应先将该业务员用假票报销的费用在会计上冲出，保留原始单据并复印单据作为证据，阐明利害关系可双方协商解决，如实在不行只有拿起法律武器先到当地主管地税机关举报，如数额巨大可直接其将移送公安机关进一步追究刑事责任。