工程会计的做账方式主要包括以下步骤：

1. 设置会计科目：根据工程项目的特点和需要，设置相关的会计科目，如工程施工、机械作业、合同毛利等。

2. 登记发生的成本：将工程施工过程中发生的各项成本，如人工费、材料费、机械使用费等，按照规定的会计科目进行登记。

3. 结转收入：在确认工程收入时，将收入结转至相关科目，如主营业务收入等。

4. 结转成本：在确认工程成本时，将工程施工过程中发生的各项成本结转至合同毛利等科目。

5. 核算利润：根据收入和成本的结转情况，核算工程项目的利润。

在做账过程中，工程会计还需要注意以下几点：

1. 确保凭证的真实性、准确性和完整性，避免出现差错。

2. 对工程项目进行独立的核算，避免与其他业务的混淆。

3. 根据工程项目的实际情况，合理设置会计科目和核算方法，确保会计信息的准确性和可靠性。

总之，工程会计需要掌握会计核算的基本知识和方法，熟悉工程项目的特点和需要，确保会计信息的真实、准确和完整，为企业的经营管理提供有效的支持。