一、如果贵公司跟开票方具有真实的交易背景：按照发票上的进项税额，会计上先做进项转出，借记：主营业务成本；贷记：应交税费----应交增值税----进项税额转出。然后跟开票方确认报废原因，协调处理方法。因为开票方本应该收齐发票所有联次以后，才能报废，它们作业不合规范。

二、如果贵公司跟开票方没有真实的交易背景：涉嫌属于购买发票、虚假抵扣偷税之嫌。处了进项税额转出，尚需引以为戒，避免国税局来查，拔出萝卜带出泥。