下肢是支持人直立行走最重要的部分。正因为有了强健有力的下肢系统人类才可以长时间的站立、行走、跑动等。大部分的下肢截肢都会借助义肢或者手杖还有轮椅等工具辅助其行走。

下肢的截肢同样存在与上肢一样的术后并发症。但由于截肢部位的不同又有各不相同的运动康复方法。踝关节以下的截肢，患者一般不会用义肢和轮椅，而很有可能使用拐杖来辅助行走。所以踝关节以下截肢的运动康复就包括了肩关节和手臂力量的练习。截肢侧的练习就要包括换关节以上的小腿和大腿、髋关节以及各个关节部分。练习主要包括：伸展小腿肌肉练习、伸展比目鱼肌练习等。膝关节以下的截肢，患者很可能会借助义肢，所以在进行锻炼的时候就包括了义肢与本身器官的协调及适应能力。同样要注意发展健侧肢的能力，用来代偿截肢带来的不便。膝关节的截肢练习主要包括：直腿升降练习、屈髋练习、伸展髋部练习、伸展健侧膝关节练习、健侧肢的各种肌肉练习。大腿根部的截肢，患者一般会借助轮椅进行日常的活动。与使用手杖一样，需要对上肢以及肩部进行一系列的锻炼来支持长时间驱动轮椅的能力。人体的髋骨具有很好的能力，可以支持人长时间坐。但高位截肢的患者要坐立的时间远远大于普通人，所以就需要患者进行一些腹部的运动锻炼。练习主要有：屈腹练习、有人协助的仰卧起坐、有人协助的髋部练习、各种腰部锻炼。