ETC发票不能抵扣的原因主要有以下几点：

一、非正规发票或无效发票

ETC发票在不符合相关规定或标准时，会被认定为非正规发票或无效发票，因此无法进行抵扣。例如，发票格式错误、信息填写不全、印章不清晰等，这些都会导致发票无效，无法作为抵扣凭证。

二、用途不符合抵扣规定

根据国家税务法规定，只有符合抵扣规定的发票才能进行抵扣。若ETC发票所记载的费用并非是企业生产经营相关的费用，比如个人消费支出，则无法进行抵扣。只有那些与生产经营有直接关系的费用发票才能用于抵扣。

三、未经认证或认证未通过

在增值税制度下，为了防范欺诈和非法抵扣，所有发票都需要经过税务部门的认证。如果ETC发票没有经过认证或者认证未通过，那么就不能进行抵扣。这涉及到发票的真伪验证、信息比对等程序，只有经过验证的发票才能确保合规可抵扣。

详细解释如下：

ETC发票作为财务报销凭证，其合法性、合规性是进行抵扣的前提。首先，必须确保发票是正规有效的，符合国家税务部门的相关规定和标准。其次，发票所记载的费用必须是与企业的生产经营活动直接相关，这是税务法规的基本要求。最后，所有发票都需要经过税务部门的认证，这是防止非法抵扣和欺诈的重要环节。因此，如果ETC发票存在以上任何问题，都会导致无法抵扣的情况发生。企业在使用ETC发票进行报销和抵扣时，务必确保发票的合规性、真实性以及有效性，以免出现无法抵扣的情况。