公司内部的往来款入账方法如下：

如果现分公司从总公司调货，相关会计分录，

总公司处理时，

借：内部往来—分公司(此时是总公司的债权性质)，

贷：存货，

分公司会计分录，

借：存货，

贷：内部往来—总公司(此时是分公司的债务性质)，

公司内部往来款入账，

借：现金/银行存款/应收账款，

贷：主营业务收入

贷：应交税费—应交增值税—销项税额，

借：原材料/库存商品等，

借：应交税费—应交增值税—进项税额，

贷：现金/银行存款/应付账款，

内部往来指的是总部与分支机构之间的往来交易。包括两种情况：

1、分支机构成立时，总部对分支结构的投资。

2、分支结构成立之后。总部与分支结构之间的商品转移。

往来款包括：应收账款、应付账款、预付账款、预收账款、其他应收款、其他应付款。

内部往来业务是集团公司和各子公司发生的业务往来。

内部往来科目是指(也就是这类业务涉及的会计科目有)：应收账款、应付账款、其他应收款、其他应付款。

比如是总公司：现分公司从总公司调货：

总公司处理：

借：内部往来-分公司(此时是总公司的债权性质)

贷：存货

分公司：

借：存货

贷：内部往来-总公司(此时是分公司的债务性质)