大专毕业生的档案应当存放在学校或人事档案管理部门。这是因为档案是学生在校期间的重要证明文件，需要妥善保管和管理，以备将来使用。档案包含了个人基本信息、学习成绩、奖惩情况等重要信息，对于个人职业发展和继续教育有着重要意义。如果档案遗失或管理不当，可能会导致一系列不必要的麻烦和损失，因此需要注意档案的安全和正确的存放方式。

学校通常设有专门的档案管理部门，负责管理学生的各类档案材料。档案管理人员会按照规定流程进行整理、归档，并确保档案的安全存放。学生在校期间，可以通过学校档案管理部门查询和获取自己的档案信息。此外，毕业生在离校后，也可以通过学校档案管理部门办理档案的转递手续，将档案转至新的工作单位或继续教育机构。

人事档案管理部门则主要负责管理在职员工的档案。对于大专毕业生而言，如果选择继续在企业或机构工作，档案可以转递至新的工作单位的人事档案管理部门。在新的工作单位，档案将继续被妥善保管和管理，以备日后使用。如果毕业生选择继续深造，档案也可以转递至新的教育机构，为其继续教育提供支持。

无论是学校档案管理部门还是人事档案管理部门，都会按照相关法律法规和规章制度进行档案管理。档案管理人员会定期对档案进行检查和维护，确保档案的安全和完整性。同时，档案管理部门也会提供相应的咨询服务，帮助毕业生了解档案管理的相关规定和流程。

总之，大专毕业生的档案应当存放在学校或人事档案管理部门，确保档案的安全和正确管理。在档案管理过程中，毕业生应当积极配合档案管理部门的工作，确保档案的顺利转递和使用。