A、取样用的塑料袋上标明地点和时间，以更统计和比较，A正确；

B、由于土壤动物具有趋暗、趋湿、避高温的特性，所以可用避光法或者避热法收集小动物，B正确；

C、对于活动能力强、活动范围大的个体调查种群密度时适宜用标志重捕法，而一般植物和个体小、活动能力小的动物以及虫卵等种群密度的调查方式常用的是样方法，所以用样方法估算蚯蚓的种群密度，C错误；

D、不知名的动物标记为“待鉴定”，但不能不统计，D正确．

故选：C．