特殊染色是指除HE及免疫组化以外的特殊染色方法，比如PAS、六胺银、Masson、苏丹Ⅲ、油红O、甲基紫等等，用于显示送检标本内的糖原、网状纤维、特殊病原体、脂质、粘液、淀粉类物质等等，便于寻找病变，常规的染色方法为HE染色，故上述染色方法统称为特殊染色。