重庆工程职业技术学院王牌专业包括：煤矿开采技术、工程测量技术、建筑工程技术、机电一体化技术等。这些专业皆属学校重点建设范畴。具体而言，其中“机电一体化技术”为国家级“双高计划”高水平专业群的核心专业，同时还是国家示范性高等职业院校的重点建设专业、国家级职业教育首批教师教学创新团队建设专业、国家级骨干专业、现代学徒制试点专业以及重庆市高等职业教育双基地项目建设专业。智能控制技术亦为国家级骨干专业，同时为全国机械行指委骨干专业、国家战略发展急需的新兴专业，属于学校高水平专业群建设计划群内骨干专业。电气自动化技术、机械设计与制造、新能源汽车技术、计算机网络技术、工程造价等多个专业均为重庆市或国家级的骨干或重点建设专业。学校开设的专业覆盖了智能制造与交通、大数据与物联网、土木工程、财经管理与旅游、资源与安全、测绘地理信息与艺术设计工程等多个领域，旨在为学生提供全面的专业知识与技能培养。