巴塞尔协议III与II之间的主要区别集中在资本工具、一级资本充足率和二级资本内容上。

首先，关于资本工具，巴塞尔III对银行资本的分类更为严格，一级资本和二级资本取代了原有的三级资本。市场风险的资本要求与信用风险并重，不再单独设立市场风险资本。

其次，一级资本充足率的门槛提高。在巴塞尔II中，一级资本充足率为4%，而在III中提升至6%。此外，协议要求银行额外储备2.5%的防护缓冲资本和不超过2.5%的反周期准备资本，使得核心资本充足率需达到8.5%至11%。总的资本充足率虽然保持在8%不变，但结构更加严格。

再者，二级资本的规定也发生了变化。在巴塞尔III中，二级资本必须具备在银行破产清算时吸收损失的能力，不再包含协议II中的某些子项，这强调了资本的稳健性和风险吸收能力。

中国对巴塞尔III的执行进展方面，官方已制定了明确的时间表，大型银行将逐步提高资本充足率。到明年底，大型银行需达到9.5%的资本充足率，到2018年底则需达到11.5%，给予六年时间逐步适应和达标。