虽然胆固醇的生物合成的部分反应与酮体生成相似，但两者的关键酶是不同的， 前者是 HMG-CoA 还原酶，后者是 HMG-CoA 合成酶。脂肪酸β一氧化过程中生成的乙酰CoA除可在肝细胞线粒体缩合成酮体外，主要通过三羧酸循环彻底氧化成CO2和H2O，并释放出能量。脂肪酸在肝脏中进行β氧化时产生乙酰辅酶A。