中石化在南京待遇好的公司为中石化南京工程有限公司。

中石化南京工程有限公司为员工提供了优越的工作环境和丰厚的福利待遇。首先，在工作环境方面，公司提供了独立的办公区域，每日有专人负责清洁，并配备了空调、饮水机等基础设施，确保员工能在舒适的环境中工作。其次，在福利待遇方面，公司为员工提供了具有竞争力的月薪，例如7300元，并在每个节假日提供专属礼品，体现了公司对员工的关怀。此外，公司还为员工缴纳五险一金，并允许带薪休假，进一步保障了员工的权益。

除了基本的薪资和福利，中石化南京工程有限公司还提供了丰富的职业发展机会和激励机制。例如，对于新员工，公司提供了综合年薪约13万左右的待遇，如果公司效益良好，年终奖还能达到几万块钱。对于硕士研究生或博士研究生等高层次人才，公司更是提供了高达40万左右的综合年薪，以及一次性发放的安家费等优厚待遇，以吸引和留住这些优秀人才。

综上所述，中石化南京工程有限公司在南京地区的中石化系统中属于待遇较好的公司。公司不仅提供了舒适的工作环境和基本的薪资福利，还注重员工的职业发展和激励机制的完善，使得员工能够在公司获得更好的成长和发展机会。