南京大学中华文化研究院下辖多个专业研究机构，致力于深入探讨和传承中华优秀文化。首先，有专注于佛教研究的人间佛教研究中心，关注佛教在现实社会中的应用和影响。

生命哲学研究中心则聚焦于哲学层面的生命探讨，探索生命的意义和价值，为人们提供深刻的思考空间。

两岸三地文化研究与交流中心，其工作重点在于加强中国与港澳台地区的文化交流，促进文化互鉴与理解。

中国古典数字工程研究中心则将科技与传统相结合，研究古代智慧与现代科技的碰撞，挖掘古典数字的现代价值。

文学研究所致力于文学作品的研究和教学，从古典到现代，从国内到国际，丰富文学视野，提升文化素养。

民族与边疆文化研究所关注民族多元性与边疆地区的文化研究，推动边疆文化的保护与传承，增强民族凝聚力。

中国书画研究院则是艺术殿堂，研究中国古代书画艺术，弘扬书画之美，推动书画艺术的当代发展。

旭日佛学研究中心则犹如晨曦中的佛光，聚焦于佛学的深入研究，为现代人们提供心灵的慰藉与智慧的启迪。