经过一年多的过渡和筹备，宁夏大学于1962年9月正式宣告成立，并于9月30日举行了成立大会。宁夏大学成立后，原宁夏农学院、宁夏医学院、宁夏师范学院三院院一级机构即行撤销，在大学下面分设各系。宁夏农学院并入宁夏大学后，农机专业和林学专业相继撤销停办。农牧两系直至1972年宁夏农学院重新建立时，在宁夏大学经历了整整9年。在此期间开始的“文化大革命”使学校的各项工作遭到了极大破坏。1969年10月学校迁往永宁县与永宁农校合并，改称宁夏大学第一分校。