创新与创业管理强化班在班级管理和运作方面，采取了一种独特的管理模式。学生的思想政治和生活管理工作，依然沿用原院、系的负责体系，而竺可桢学院则承担起强化班课程的教学管理工作。班级内部的日常运作和事务安排，由学生自主选举的班干部组织进行，鼓励学员积极参与并提供教学反馈与建议。

强化班拥有多个特色项目组，如企业家导师项目、Family项目、ITP大讲坛以及教学促进小组和顾问团，这些项目旨在提升学员的实践能力和专业素养。同时，还有英语训练营、读书会和实践平台等兴趣小组，丰富了学员的业余生活，激发创新思维。班刊《创想》（原名《教务评论》）的发行，更是为学员提供了交流和展示的平台。

班歌《梦与追求》由02级强化班学员陈艺超和王润宇创作，旨在纪念强化班成立五周年，歌词中“心有多大，舞台就有多广”激励着每位学员追求梦想，共同建设未来。在班级运作中，班委更像是一个实际的项目统筹部门，采用项目化管理模式，通过快速行动小组的组织，学员们分工协作，不仅将课程中的管理理念应用于实践，还为个人能力发展提供了广阔空间。