周口市科学技术局内设机构主要包括以下几个部门：

办公室，负责机关政务协调、制度制定、文电、会务、档案、督办查办、宣传、新闻发布、规范性文件审核、科技史志编纂等，还管理办公自动化、保密、信访、安全保卫和计划生育工作。

发展计划科，研究全市科技发展战略，制定中长期科技发展规划和科技发展年度计划，管理科技计划经费配置，规划布局科技创新基地，推动区域和县科技发展，审核科研机构组建和调整事宜，负责科技兴贸工作，管理科技评估和统计。

高新技术发展及产业化科，拟订高新技术发展及产业化的规划和政策措施，组织实施相关领域的重大科技专项、重大科技攻关、科技成果转化计划项目，管理工程技术研究中心和科技创新平台建设，推动工业科技进步和高新技术产业化，负责高新技术企业认定工作和市级高新技术产业开发区工作。

农村科技科，拟订科技促进农村发展的规划和政策措施，组织实施相关领域的重大科技专项、重点科技攻关、科技成果转化计划，管理工程技术研究中心和科技创新平台建设，指导农村重大科技产业示范、农村科技服务体系建设和科技扶贫等涉及农村的科技工作，指导全市科技类民办非企业单位发展。

科技成果管理科，拟订科技成果转化的规范性文件、规章草案和政策，统筹科技成果转化工作，负责科技奖励工作，管理科技成果保密工作，管理技术出口项目的技术审查和保密审查，管理技术贸易机构、科技中介服务机构，指导和协调技术贸易活动，负责技术合同认定登记、统计和技术合同仲裁工作。

社会发展科技科，拟订社会发展领域科技发展规划和政策措施，组织实施相关领域的重大科技专项、重点科技攻关、科技成果转化计划，管理工程技术研究中心和科技创新平台建设，推进全市可持续发展能力建设，组织协调可持续发展实验区工作。

人事科（老干部科），负责机关和直属单位的人事工作和机构编制工作，承担科技系统干部培训工作，负责机关和所属单位的党群工作，管理离退休干部工作，负责行政事业费管理，编制科技经费预决算，编制和管理机关和所属单位的基本建设计划，监管国有资产和重大经济活动。