1. 取证层次不同：执业药师是国家统一考试，全国范围认可，而药师证则是在省级药监局组织考试，仅在省内有效。

2. 认证资格有别：执业药师是经过全国统一考试合格，取得《执业药师资格证书》并注册后，在药品生产、经营、使用单位中执业的药学技术人员。药师则是具有药学专业知识，取得药学专业技术职称并从事药学工作的技术人员。

3. 概念范围各异：执业药师是药学技术人员的一部分，但并非所有药学技术人员都是执业药师。执业药师一定是药学技术人员。

4. 职称等级区分：药师是一种职称，分为中药师和西药师，两者待遇相同但专业不同。职称级别分为初级、中级、副高和正高。

5. 晋升路径清晰：中药师的晋升顺序为中药师、主管中药师、副主任中药师、主任中药师；西药师的晋升顺序为西药师、主管西药师、副主任西药师、主任西药师。两者都属于初级职称，在业务技术上有指导关系。

6. 药店配置要求：药店必须配备执业药师。若经营西药，需配备西药执业药师；若经营中药，需配备中药执业药师。若中西药都经营，则无论是否已有西药执业药师，都必须有中药执业药师。