目标院校确实是知道公共课成绩的。

在考研过程中，公共课的阅卷由考生报考院校所在的省级招生办公室负责。当初试成绩公布后，如考生对成绩产生疑问，有权向目标院校提出复查申请，学校会按照相关复查规定和流程进行成绩复查。

在考生申请复查后，目标院校会接收省级招生办公室转交的复查申请材料，根据学校内部流程，对成绩进行再次审核。这一过程可能包括对原始试卷的再次核对、评分标准的重新评估等步骤。复查结果将由学校通知考生，若成绩确有错误，会及时更正并公布。

在整个过程中，目标院校始终能获取公共课成绩信息，以便对考生申请进行处理。这有助于确保成绩复查的公正性和透明度，维护考生的合法权益。

综上所述，目标院校在考研过程中确实能掌握公共课成绩，通过省级招生办公室的组织和监管，确保成绩的准确性和考生权益的保护。